Der Stiftungsrat
Im Stiftungsrat sitzen Vertreter und Vertreterinnen von Bund, Kantonen, Lehrerinnen- und Lehrerverbänden und privaten Organisationen. Der Stiftungsrat hat die Oberaufsicht über alle Tätigkeiten der Stiftung und tritt mindestens zweimal jährlich zusammen.

Der Ausschuss
Der Ausschuss besteht aus fünf Mitgliedern des Stiftungsrates und steht unter der Leitung des Vizepräsidenten des Stiftungsrates. Er übt die unmittelbare Aufsicht über die Tätigkeit der Geschäftsleitung aus und berät und unterstützt sie bei der Wahrnehmung ihrer Aufgaben. Er tritt mindestens viermal jährlich zusammen.

Das Zentralsekretariat
Das Zentralsekretariat ist die Geschäftsstelle der Stiftung mit Sitz in Bern. Der Zentralsekretär trägt die Gesamtverantwortung sowohl für die operationelle Tätigkeit wie auch für die gute Entwicklung der Stiftung. Er präsidiert die Geschäftsleitung, welche neben ihm die Leiter und Leiterinnen der vier Regionalstellen umfasst.

Geschäftsleitung
Die Geschäftsleitung der Stiftung Bildung und Entwicklung besteht aus den Leiterinnen und Leitern der Regionalstellen sowie dem Zentralsekretär. Sie trägt gegenüber dem Stiftungsrat die Gesamtverantwortung für die Tätigkeiten und die Organisation des Zentralsekretariats und der Regionalstellen.

Die Regionalstellen
Die Stiftung unterhält in drei Sprachregionen der Schweiz Regionalstellen. Sie sorgen für eine praxis- und bedürfnisnahe Umsetzung des Mandats der Stiftung und bieten den Lehrerinnen und Lehrern ihrer Region die Dienstleistungen der Stiftung an.

Die Fachstelle für eine Welt
Filme für eine Welt wurde 2007 in die Stiftung Bildung und Entwicklung integriert. Die Fachstelle hat den Auftrag, Filme und Videos für Unterricht und Erwachsenenbildung im Bereich Entwicklung und Kulturbegegnung anzukaufen sowie deren Einsatz zu fördern. Damit soll das Interesse an entwicklungsbezogenen Themen geweckt und ein bewussterer Zugang zu anderen Kulturen gefördert werden.
Die Arbeit der Fachstelle wird von Brot für alle, Fastenopfer, Caritas, HEKS, Missio und weiteren Mitgliedern der Interessengemeinschaft Missionsinstitute finanziell unterstützt.

Die pädagogische Kommission
Die pädagogische Kommission setzt sich aus ausgewiesenen Fachleuten aus dem Bildungsbereich der ganzen Schweiz zusammen. Ihre Aufgabe ist eine doppelte; zum einen soll sie die Tätigkeit der Stiftung kritisch begleiten, zum andern gedankliche und konzeptionelle Vorarbeit für die Weiterentwicklung von Profil und Programm der Stiftung leisten.

Die Projektkommission
In der Projektkommission sitzen externe Fachleute aus dem Bildungs- und Kulturbereich. Sie sind für die Beurteilung von Bildungsprojekten zuständig, welche von Schulen zu den Themen Nord-Süd und Rassismus eingegeben werden können.